Вы же сами пишете, что

Он сам собирался покупать этот дом или для Вас подавал эту заявку?
На мой взгляд, тут вариантов всего три: оплачивать в полном объеме, договариваться с маклером о снижении суммы, беззастенчиво врать, что договаривались, например, о 1000 евро. Причем последнее начинать подкреплять ответными письмами маклеру, что мол, как же так, удивлен Вашим письмом, уважаемый, мы же с Вами устно договаривались о 1000 евро, почему же, уважаемый, Вы выставляете счет на 6000. Ждать ответ и опять продолжать в таком же духе. Все остальные, как бы честные телодвижения приведут к оплате 6 тысяч + судебных издержек.
И собственно, то что Вам удалось исключить из договора купли-продажи пункт об оплате маклерских услуг, будет лить воду на Вашу мельницу и подтверждать Ваши утверждения о новых договоренностях с маклером. Вот, вы договорились, из ДКП пункт исключили, сидите ждете счет, счет приходит и Вы испытываете шок от суммы. А сейчас пытаетесь понять, что происходит. Но выдержку надо будет иметь железную, потому что есть традиции делового оборота и в случае с маклерами они таковы, что их вознаграждение берется как бы с потолка и как бы ни за что /за рекламу, один показ, да эскиз ДКП/, а суды придерживаются этих традиций и судят так как принято. Ссылок Вам уже накидали.