Какие сложности возникают при создании онлайн мессенджера у програмистов!?

Не хочу тебя огорчать, но большинство пользуется уже готовыми.

Отсутствие финансирования.

Это равносильно тому что большинство сейчас управляет автомобилями 2009 года выпуска. :)

На что в большей степени идут затраты при создании мессенджеров?

Сетевой код - взаимодействие клиента с сервером, самая сложная и объёмная часть. На отладку уходит больше всего времени.
Впрочем, когда я этим занимался, ничего вменяемого из высокоуровневых библиотек не было, писал на С++ используя winsock строя соединения по UDP/IP. В VCL Delphi/CBuilder были компоненты, но слишком примитивные. Не знаю, может сейчас есть что-то нормальное в библиотеках классов к какому-нибудь компилятору...

ACE вроде уж давно существует... Ну а сейчас Boost.Asio лучше юзать.

Фиг его знает, было оно в 1999 или нет.

Сетевой код - взаимодействие клиента с сервером, самая сложная и объёмная часть.
В VCL Delphi/CBuilder были компоненты
------
Были доступны и другие компоненты, существенно, по сравнению со стандартными, облегчавшие жизнь...
Писанины там, относительно, немного, даже если реализовывать собственный протокол...

Если на коленке делать, то да.
Ну с WCF на C# коммуникационная часть пишется очень быстро и практически сразу работает. В случае если контракт простой и не пытается объять необъятное и засунуть HD видеотелефонию и прочие свистелки и перделки в тот же канал коммуникационная часть пишется за день.
Наверняка и для явы подобные стандартные средства реализаыции веб-сервисов существуют, да и другие кросс-платформенные библиотеки есть.
Более сложной для больших систем является, помоему, проблема скалирования, балансировки нагрузки - как сделать так что бы у миллионов пользователей ничего не тормозило. Тут и база учетных записей пользователе, и бадди списики, оффлайновые сообщения. И самое главное, что бы получать профит нужно все это еще уметь продать, встроить рекламу, в идеальном случае с таргетингом. Ну и еще нужны блэкджек и шлюхи, что бы люди себе его таки установили.
Но все это делается, так что самое сложное: найти того, кто захочет в это дело инвистировать и конкурировать с ICQ, Skype, MSN, AIM и прочими.

Спасибо всех за ответы.
Еще такой вопрос!
Сколько будет стоить программная часть при условии того что будет только ЧАТ и телефония ! Без видео звонков и конференций.
Заранее благодарен за ваши ответы.