Установка необходимого ПО может быть отметкой чекбоксов в процессе заказа и конфигурирования выбранной машины, или же установкой или доустановкой стандартными средствами операционной системы, в зависимости от хостера, выбранного пакета и ОС. С Админ панелью, даже если ее по дефолту нет, тоже примерно также....в любом случае, установка ПО не представляет собой никаких сложностей, главное, все это дело правильно настроить. Часто вы можете воспользоваться услугами админов хостера, или же нанять специалиста со стороны(если нет своего) - проконсультируйтесь по всем вопросам там и там, уточните, сколько будет стоить установка и настройка того что вам нужно у хостера и у стороннего спеца, и примите решение.
По последнему вопросу - возможны варианты, либо вам надо поднять свой dns сервер, и указать нужные ns в панели вашего регистратора, либо использовать dns регистратора, и тогда в той же панели изменить пару записей, внеся туда ip адрес вашего сервера. Или же есть еще варианты использовать сторонние dns, если например с первым не хотите заморачиваться, а второе например у вашего регистратора по каким то причинам нельзя.... хотя с последним я сталкивался только один раз.
Суммируя, повторю, что на мой взгляд, установка ничто, настройка - тонкая грамотная настройка - все, главное отличие хостинга на выделенном сервере(кстати, вопрос, таки уверены, что речь именно о выделенном, dedicated server, или может быть, о виртуальном, VPS-VDS?) и на шаред хостинге в том, что вы получаете неизмеримо большие возможности и пропорционально же большую ответственность, поэтому вы должны быть уверены, что у вас все необходимое вам ПО не просто установлено, но и грамотно и правильно настроено, и защищено.
Где-то так.