Таки две большие разницы. В современной физике частица описывается при помощи так называемой волновой функции (Wellenfunktion). Возможно, в будущем будет найден другой метод, но пока что этот дает очень хорошие результаты: таким образом можно например обьяснить эксперимент, ссылку на который я дал выше, не говоря уже о многочисленных других феноменах.С классическими представлениями о "расстоянии" между электронами, которые вращаются на неких орбитах и "скачут туда-сюда" строение атома невозможно описать согласованно с экспериментальными результатами. Вопрос, который Вы себе задали, наука "прошла" почти СТО лет назад!
В свое время модель Бора также давала хорошие результаты, например, точно описывала спектральные линии водорода, но вот интенсивность спектральных линий обьяснить при помощи этой модели уже было невозможно. Да и для атомов с бОльшим количеством электронов она стала давать результаты, несоответствующие экспериментальным данным.
Поэтому эта модель была уточнена и расширена в рамках квантовой механики (Schroedinger, 1925).
В хронологической последованности:
http://de.wikipedia.org/wiki/Thomsonsches_Atommodell
http://de.wikipedia.org/wiki/Rutherfordsches_Atommodell
http://de.wikipedia.org/wiki/Bohrsches_Atommodell
http://de.wikipedia.org/wiki/Quantenmechanik