Вход на сайт
Равновесие Харди-Вайнберга
06.08.11 12:20
!!! скопипастила из одной Группы. Может кто-нибудь помочь? Очень важно!!!
Если есть желание, помогите, пожалуйста, разобраться. Я уже в отчаянии, уже несколько карандашей изгрызла.
Равновесие Харди-Вайнберга
Дано
Генотипы Больные (n=63 чел.) Здоровые (n=46 чел)
Имеющееся кол-во (больные)
СС=28
АА=5
С/А=30
Имеющееся кол-во (здоровые)
СС=23
АА=2
С/А=21
Ожидаемое кол-во (больные)
СС=29,35
АА=6,35
С/А= 27,3
Ожидаемое кол-во (здоровые)
СС=24,39
АА=3,4
С/А=18,21
До этого места все ясно, ожидаемое кол-во рассчитывалось по принципу:
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (23+21/2)/46=0,728
далее , чтобы установить ожидаемое кол-во аллелей, ( f(C)² x n)= (0,728)²x 46=24,39
Генотипы
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
с этим тоже пока все понятно.
Зато дальше идет:
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
Я понимаю, что идет рассчет равновесия Харди-Ваинберга, и что если χ²<0,05, то равновесие нарушено. В данном случае оно не нарушено.
Но я не понимаю, по какому принципу рассчитывались здесь р и χ²?
Если есть желание, помогите, пожалуйста, разобраться. Я уже в отчаянии, уже несколько карандашей изгрызла.
Равновесие Харди-Вайнберга
Дано
Генотипы Больные (n=63 чел.) Здоровые (n=46 чел)
Имеющееся кол-во (больные)
СС=28
АА=5
С/А=30
Имеющееся кол-во (здоровые)
СС=23
АА=2
С/А=21
Ожидаемое кол-во (больные)
СС=29,35
АА=6,35
С/А= 27,3
Ожидаемое кол-во (здоровые)
СС=24,39
АА=3,4
С/А=18,21
До этого места все ясно, ожидаемое кол-во рассчитывалось по принципу:
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (23+21/2)/46=0,728
далее , чтобы установить ожидаемое кол-во аллелей, ( f(C)² x n)= (0,728)²x 46=24,39
Генотипы
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
с этим тоже пока все понятно.
Зато дальше идет:
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
Я понимаю, что идет рассчет равновесия Харди-Ваинберга, и что если χ²<0,05, то равновесие нарушено. В данном случае оно не нарушено.
Но я не понимаю, по какому принципу рассчитывались здесь р и χ²?
я не яся
NEW 06.08.11 14:35
Статья у меня в напечтанном виде, ссылок вроде нет
Проблема в том, что в своем натуральном виде (в виде таблиц), все выглядит намного проще...Но я не могу сюда таблицы выложить, к сожалению, поэтому и пришлось все в виде текста...
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (28+30/2)/63=0,683
Как я поняла, это значение имеет отношение только частоте аллелей С и А, к
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
Вот к этим значениям и имеют отношение р и χ²
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
Проблема в том, что в своем натуральном виде (в виде таблиц), все выглядит намного проще...Но я не могу сюда таблицы выложить, к сожалению, поэтому и пришлось все в виде текста...
В ответ на:
Аллель С (больн.) =86 (0,683)...
Это Allelfrequenz des C-Allel/частота аллели С -здесь пока все сходится. Рассчитывалось по формулеАллель С (больн.) =86 (0,683)...
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (28+30/2)/63=0,683
В ответ на:
.р (больных) =0,897
.р (больных) =0,897
Как я поняла, это значение имеет отношение только частоте аллелей С и А, к
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
Вот к этим значениям и имеют отношение р и χ²
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
NEW 06.08.11 17:32
я вроде это же самое и предполагал: б) его статистика хи-квадрат и его вероятность пэ из нижней таблицы относятся к другой гипотезе
только тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)
никто не сравнивает здоровых и больных (исправлю, лучше так: никто не сравнивает АА и СС)
сравниваются цыфири
В ответ на:
Могли ли сравниватся эти 3 генотипа АА, С/А и СС?
Могли ли сравниватся эти 3 генотипа АА, С/А и СС?
я вроде это же самое и предполагал: б) его статистика хи-квадрат и его вероятность пэ из нижней таблицы относятся к другой гипотезе
только тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)
никто не сравнивает здоровых и больных (исправлю, лучше так: никто не сравнивает АА и СС)
сравниваются цыфири
NEW 06.08.11 17:44
Если я правильно понимаю, равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием? Тогда он будет накапливаться в группе "больных"
Но подождите, ведь, насколько я поняла, сравнивают не с абстрактной квантилью 0,05, а с тем (извините, попытаюсь обьяснить как смогу) сколько процентов эта аллель встречается от общего кол.-ва пациентов, в случае, например, с аллелью С (86:63)=1,365, и это число можно поставить как квантиль в SPSS/Binomial, и посмотреть, что получится.
Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается
В ответ на:
олько тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции
олько тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции
Если я правильно понимаю, равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием? Тогда он будет накапливаться в группе "больных"
В ответ на:
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)
Но подождите, ведь, насколько я поняла, сравнивают не с абстрактной квантилью 0,05, а с тем (извините, попытаюсь обьяснить как смогу) сколько процентов эта аллель встречается от общего кол.-ва пациентов, в случае, например, с аллелью С (86:63)=1,365, и это число можно поставить как квантиль в SPSS/Binomial, и посмотреть, что получится.
В ответ на:
сравниваются цыфири
сравниваются цыфири
Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается
NEW 06.08.11 20:49
это точно не математика, тут помочь не могу
и скорее всего во всей работе не встречаются слова "равновесие будет/не будет нарушено", как-то это не ... э-э ... ненаучно что-ли
там я думаю есть более мягкие слова, типа "равновесие будет устойчиво/неустойчиво"
я только в прогнозах погоды встречал такие жёсткие формулировки
ни или так
но не сравниваются генотипы
в ответ alisaxarms 06.08.11 17:44
В ответ на:
равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием?
равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием?
это точно не математика, тут помочь не могу
и скорее всего во всей работе не встречаются слова "равновесие будет/не будет нарушено", как-то это не ... э-э ... ненаучно что-ли
там я думаю есть более мягкие слова, типа "равновесие будет устойчиво/неустойчиво"
я только в прогнозах погоды встречал такие жёсткие формулировки
В ответ на:
Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается
Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается
ни или так
но не сравниваются генотипы
NEW 07.08.11 05:57
в ответ 341256 06.08.11 14:47