русский
Germany.ruForen → Архив Досок→ Wer will alles wissen?

Равновесие Харди-Вайнберга

2434  1 2 3 alle
  дактиль падчерица06.08.11 12:20
06.08.11 12:20 
!!! скопипастила из одной Группы. Может кто-нибудь помочь? Очень важно!!!
Если есть желание, помогите, пожалуйста, разобраться. Я уже в отчаянии, уже несколько карандашей изгрызла.
Равновесие Харди-Вайнберга
Дано
Генотипы Больные (n=63 чел.) Здоровые (n=46 чел)
Имеющееся кол-во (больные)
СС=28
АА=5
С/А=30
Имеющееся кол-во (здоровые)
СС=23
АА=2
С/А=21
Ожидаемое кол-во (больные)
СС=29,35
АА=6,35
С/А= 27,3
Ожидаемое кол-во (здоровые)
СС=24,39
АА=3,4
С/А=18,21
До этого места все ясно, ожидаемое кол-во рассчитывалось по принципу:
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (23+21/2)/46=0,728
далее , чтобы установить ожидаемое кол-во аллелей, ( f(C)² x n)= (0,728)²x 46=24,39
Генотипы
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
с этим тоже пока все понятно.
Зато дальше идет:
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
Я понимаю, что идет рассчет равновесия Харди-Ваинберга, и что если χ²<0,05, то равновесие нарушено. В данном случае оно не нарушено.
Но я не понимаю, по какому принципу рассчитывались здесь р и χ²?
я не яся
#1 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 14:01
fuedor2003
NEW 06.08.11 14:01 
in Antwort дактиль 06.08.11 12:20, Zuletzt geändert 06.08.11 14:02 (fuedor2003)
если я спросонья все кнопочки на калькуляторе нажимал правильно, то хи-квадрат для больных будет

#2 
  дактиль падчерица06.08.11 14:11
NEW 06.08.11 14:11 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 14:01
а в Курилку девушке можешь продублировать?
ну, она тебе наверное спасибо скажет ))
#3 
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 14:12
NEW 06.08.11 14:12 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 14:01, Zuletzt geändert 06.08.11 14:16 (alisaxarms)
Спасибо, но это же Odds Ratio???
Я проверяла по
χ²=(n(ad-bc)²)/(a+b)*(a+c)*(c+d)*(b+d)
тоже не сошлось.
А статья опубликована, по идее все рассчеты должны быть правильными
#4 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 14:19
fuedor2003
NEW 06.08.11 14:19 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 14:12
это формула критерия согласия Пирсона
...
меня не покидает ощущение недочитанности
давайте статью, а то что-то тут непонятно
В ответ на:
Генотипы
Аллель С (больн.) =86 (0,683).....
....
...р (больных) =0,897

0,683 - это и есть р (больных)
#5 
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 14:35
NEW 06.08.11 14:35 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 14:19, Zuletzt geändert 06.08.11 14:52 (alisaxarms)
Статья у меня в напечтанном виде, ссылок вроде нет
Проблема в том, что в своем натуральном виде (в виде таблиц), все выглядит намного проще...Но я не могу сюда таблицы выложить, к сожалению, поэтому и пришлось все в виде текста...
В ответ на:
Аллель С (больн.) =86 (0,683)...
Это Allelfrequenz des C-Allel/частота аллели С -здесь пока все сходится. Рассчитывалось по формуле
частота аллели f(C) =(СС+ 1/2С/А)/n
f( C)= (28+30/2)/63=0,683
В ответ на:
.р (больных) =0,897

Как я поняла, это значение имеет отношение только частоте аллелей С и А, к
Аллель С (больн.) =86 (0,683)
Аллель С(здор.)=67 (0,728)
Аллель А(больн.)=40 (0,318)
Аллель А (здор.)=25(0,272)
Вот к этим значениям и имеют отношение р и χ²
р (больных) =0,897
χ² (больных)=0,258
р (здоровых) =0,441
χ² (здоровых)=0,441
#6 
  341256 местный житель06.08.11 14:47
NEW 06.08.11 14:47 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 14:35
сканнера нет? дигитальной камеры?
#7 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 14:53
fuedor2003
NEW 06.08.11 14:53 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 14:35
для решения проблемы сканирования у Вас есть ещё полчаса
потом будет футбол
#8 
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 14:53
NEW 06.08.11 14:53 
in Antwort 341256 06.08.11 14:47
А это идея! Попробую
#9 
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 15:35
NEW 06.08.11 15:35 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 14:53
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 15:48
NEW 06.08.11 15:48 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 15:35
Графа в середине замазюкана, потому что там были данные, не имеющие отношения к вопросу (еще одно заболевание)
#11 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 16:31
fuedor2003
NEW 06.08.11 16:31 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 15:35
у меня два предположения:
а) автор статьи ошибся
б) его статистика хи-квадрат и его вероятность пэ из нижней таблицы относятся к другой гипотезе
давайте предыдущие страницы
#12 
  alisaxarms знакомое лицо06.08.11 17:09
NEW 06.08.11 17:09 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 16:31
На предыдущих страницах приводится такая же статистика по другим генам. Никаких обьяснений там нет. Это -диссер, все было защищено и опубликовано, исходя из этого вероятность ошибки я думаю, невелика.
#13 
  alisaxarms местный житель06.08.11 17:14
NEW 06.08.11 17:14 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 17:09, Zuletzt geändert 06.08.11 17:41 (alisaxarms)
Скажите, как по вашему, с какой формулой могли производится рассчеты?
#14 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 17:32
fuedor2003
NEW 06.08.11 17:32 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 17:14, Zuletzt geändert 06.08.11 17:35 (fuedor2003)
В ответ на:
Могли ли сравниватся эти 3 генотипа АА, С/А и СС?

я вроде это же самое и предполагал: б) его статистика хи-квадрат и его вероятность пэ из нижней таблицы относятся к другой гипотезе
только тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)
никто не сравнивает здоровых и больных (исправлю, лучше так: никто не сравнивает АА и СС)
сравниваются цыфири
#15 
  alisaxarms местный житель06.08.11 17:44
NEW 06.08.11 17:44 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 17:32, Zuletzt geändert 06.08.11 18:00 (alisaxarms)
В ответ на:
олько тут нет речи о сравнении генотипов, тут выдвинута гипотеза о равновесии популяции

Если я правильно понимаю, равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием? Тогда он будет накапливаться в группе "больных"
В ответ на:
чтобы принять или отвергнуть эту гипотезу вводится статистика хи-квадрат и сравнивается её значение с заранее заданной квантилью (в данном случае видимо 0,05)

Но подождите, ведь, насколько я поняла, сравнивают не с абстрактной квантилью 0,05, а с тем (извините, попытаюсь обьяснить как смогу) сколько процентов эта аллель встречается от общего кол.-ва пациентов, в случае, например, с аллелью С (86:63)=1,365, и это число можно поставить как квантиль в SPSS/Binomial, и посмотреть, что получится.
В ответ на:
сравниваются цыфири

Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается
#16 
fuedor2003 коренной житель06.08.11 20:49
fuedor2003
NEW 06.08.11 20:49 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 17:44
В ответ на:
равновесие может быть нарушено, если какой-то ген связан с заболеванием?

это точно не математика, тут помочь не могу
и скорее всего во всей работе не встречаются слова "равновесие будет/не будет нарушено", как-то это не ... э-э ... ненаучно что-ли
там я думаю есть более мягкие слова, типа "равновесие будет устойчиво/неустойчиво"
я только в прогнозах погоды встречал такие жёсткие формулировки
В ответ на:
Там же вроде не цыфири, а биномиальное распределение (есть аллель/нет аллели) сравнивается

ни или так
но не сравниваются генотипы
#17 
  alisaxarms местный житель06.08.11 21:32
NEW 06.08.11 21:32 
in Antwort fuedor2003 06.08.11 20:49, Zuletzt geändert 06.08.11 21:33 (alisaxarms)
Спасибо!Большое!Как футбол? У нас тут салют, кто кого победил?
#18 
  femidav коренной житель07.08.11 05:56
NEW 07.08.11 05:56 
in Antwort alisaxarms 06.08.11 17:09
В ответ на:
Это -диссер, все было защищено и опубликовано, исходя из этого вероятность ошибки я думаю, невелика.

Какая наивность! Из медиков-биологов вообще мало кто разбирается в математике. Так и эта дамочка явно гонит в своих расчетах.
#19 
  femidav коренной житель07.08.11 05:57
NEW 07.08.11 05:57 
in Antwort 341256 06.08.11 14:47
В ответ на:
сканнера нет? дигитальной камеры?

Гугол рулит
#20 
1 2 3 alle