Можно ли поставить апостиль на документы у немецкого нотариуса, например?

Нет, конечно.

Подскажите пожалуйста какая организация в Франкфурте на Майне ставит апостили на СОР и свидетельство о регистрации брака?

На немецкие СОР и СОБ, выданные изначально во Франкфурте? Тогда надо обращаться в Regierungspräsidium Darmstadt, отдел апостилей: https://rp-darmstadt.hessen.de/soziales/beglaubigungen-apo...
Рекомендую туда позвонить или написать и уточнить, в каком виде они хотят видеть СОР и СОБ, прежде всего, надо ли выписывать новые, чтобы были не старше полугода и.т.д. В докоронные времена апостиль на подходящий документ можно было заказать по почте, приложив сопроводительное письмо, в котором надо было обязательно указать, для какой страны требуется апостиль, документ присылали обратно с уже поставленным апостилем примерно через неделю. Какие сейчас сроки и требования, я не в курсе.

Если же СОР и СОБ были изначально выданы не во Франкфурте, а в другом городе, Regierungspräsidium может быть и другой, это зависит от того, какой округ Хессена изначально выдал эти документы. Если вообще в другой федеральной земле, то, соответственно, апостиль ставит местное учреждение (они везде чуть-чуть разные).