Можно ли утверждать, что запустение Коразима, Бейтсаиды и Кафернаума были просто закономерными событиями,

Во первых предсказание это указание события вместе во временем. Что указано в том "предсказании", о котором упоминаете вы?

Событие - что было предсказано и что произошло:

иру и Сидону отраднее будет в день суда, нежели вам...до ада низвергнешься..земле Содомской отраднее будет в день суда

окончательно запустел в 15. в...запустела в ср. века...: оставлен жителями к 11. веку

Мда, несколько не то.

Теперь когда. 11-15 века. Через полторы тысячи лет. А с чего вы решили, что это те же самые города? Что в них того же самого? Люди? Строения? Кому пророчествовал Иесус? Куску земли?

Теперь дальше. А почему собственно средневековье? Что происходило в 11-15 веке? А появились носители демократии с крестами на плащах. И толпы мессионеров. Вы не задумывались, что не пророчество сбылось, а его сбыли. Что люди просто побоялись жить в "проклятых" городах? Когда толпа народа с мечами была готова напомнить жителям города, что они "совершили" тысячу лет назад?