сын проходил sicherheitsüberprüfung bei bundeswehr, во время которой ему было настоятельно рекомендовано не ездить в Россию... дама проводившая беседу обосновывала это тем, что во время нахождения в России он Российский гражданин и подчиняется ее законам, и если его там заберут в армию, то Германия вмешаться не сможет...

ну по сути дама права, на территории РФ, он будет только как гр. РФ и Германия никаким боком, хоть у него и немецкое гражданство имеется,
но если он там не проживает на постоянной основе, то и воинскому учету не подлежит, как и в армию его никто не заберет.

То, что выше пишут, про хватают и в армию, я если честно не слышу, прецедентов таких, от знакомых ни разу не слышала, что бы чей то сын вот так был пойман в метро и в один день отправлен в армию.
Осторожность конечно никогда не помешает, в таком случае, имхо лучше въезжать/выезжать через РБ, потому как белорусам пофиг на обязанности гр.РФ по армии в частности, главное, что бы в розыске по уклонению не проходил, а проходить он не может, т.к. ни прописки, ни на учете не стоит.