У Вас больше времени. Тогда бы я маршрут немного поменяла.

1 день Метро Невский проспект (там 4 выхода, один как раз на Михайловскую улицу) и мимо гранд отеля Европа на Площадь искусств (памятник Пушкину и Русский музей), через Инженерную улицу по каналу Грибоедова к Спасу на крови ( возможно с посещением, но может быть очередь и платно), далее к Марсову полю, Инженерный замок и посещение Летнего сада, выйти у Невы ( если выход открыт или обратно и через Марсово поле) через Троицкий мост к Петропавловской крепости, осмотр крепости и собора (усыпальница Романовых, там и Пётр 1 похоронен), возможно кораблики (в Петропавловке есть причал), через невзрачную арку в крепости (площадь где монетный двор и собор) выйти к Васильевскому острову, здание биржи, Ростральные коллоны, (напротив Зоологического музея остановка корабликов), через Дворцовый мост к Эрмитажу и на Дворцовую площадь, через Александровский парк к Адмиралтейству и к памятнику Медный всадник, Иссакиевский собор ( можно на купол забраться помимо самого собора), Исаакиевская площадь, выйти на речку Мойка, по ней до Невского проспекта и тут решать куда ещё хочется, если есть силы и время. От этой точки 5 минут до метро Адмиралтейской и 10 минут до метро канал Грибоедова/Невский проспект. На Невском куча кафешек на все вкусы и кошельки.

2 день - Петродворец, вечером театр/прогулка по каналам на кораблике (Есть 2 вида маршрутов по Питеру на воде - исключительно по Неве и по каналам плюс чуть чуть по Неве)

3 день Пушкин, вечером прогулка по каналам на кораблике/театр

Сейчас в Питере куча панорамных кафе-ресторанов. Цены там не самые бюджетные, но хотя бы чашку кофе с пироженкой там стоит отведать.

Например на Невском:

"Терасса" сразу за Казанским собором

https://www.google.com/search?q=%D0%BF%D0%B8%D1%82%D0%B5%D...

"Москва" у Московского вокзала

https://www.google.com/search?newwindow=1&client=firefox-b...