Мы при первом посещении Израиля поступили так. Разделили время поездки на две части, пребывание в Иерусалиме и пребывание в Тель-Авиве. Не говоря о самих городах, они удобны в качестве отправной точки для поездок по стране. Самостоятельная организация не составляет никаких проблем. Перелетов из Германии масса, вкл. лоукосты. Выбор отелей большой. Если хотите съэкономить, не теряя в уровне отеля, рекомендую остановиться в Иерусалиме на границе "арабской" и "еврейской" части города, но со стороны "арабской". Цены дешевле, но при этом чисто (не как "в глубине" "арабских" кварталов), комфортно и намного лучше завтраки. (Позднее останавливался в "еврейской" части, имел возможность сравнить). Да и практически у стен старого города. Поездки по стране заказывали тут http://myizrail.ru/ Всем довольны (организация, транспорт, компетентность экскурсоводов, цены). Немало мест можно посетить и вовсе самостоятельно. Например, в Хайфу из Тель-Авива регулярно ходят два рейсовых автобуса (прим полтора часа в пути) и поезд (1 час). Но мы решили не заморачиваться и не терять время и воспользовались готовыми программами указанного турбюро.