Почему была выбрана эта база? Вам было известно, что

The current version for FileMaker Server 16 is offered as trial software that expires on September 27, 2018. Once the trial expires, the feature will cease to operate. This feature was designated as a trial to gather more customer feedback and help improve the Data API.

? Вы знаете, сколько будет стоить лицензия?

Filemaker API лежит свободно в интернете, т.е. как достать данные из Вашей БД, можно прочитать, попробовать и понять.

А какие формы и на какой платформе реализована "вебформа госучреждения", Вы нам не сказали. Или ее еще нет, и ее нужно созлавать? Как происходит процесс заполнения сегодня? Опишите поподробнее все, что Вам известно (даже если значения слов не понимаете), и сколько Вы готовы выложить "за все", где находитесь Вы, где - госучреждение (если задача требует обязательного присутствия, а хотя бы пару раз придется побывать на месте, и это тоже стоит денег). Тогда народу будет проще оценить, стоит ли в эту историю ввязываться.