имеется besondere öffentliche Interesse

Какой именно?

Пришел ответ, что из-за короны сроки увеличены, поэтому ждите. И в конце милая приписка, мол Verwaltungsgericht Frankfurt (почему Франкфурт - непонятно, там же подсудность по месту нахождения RP Darmstadt - VG Darmstadt)

Потому что это рядом. Но RP же не написал, что речь идёт об исках относительно бездеятельности по заявлениям о натурализации, поэтому это могли бы (и, скорее всего, были) другие заявления, например, в АВН и/или BAMF. В Вашем случае подавать иск действительно следует в VG Darmstadt, потому что принимает решение по заявлению на натурализацию RP Darmstadt.

Мне сдается, они просто пытаются таким образом напугать, чтобы я в суд не подавал.

Да, судя в первую очередь по полужирному подчёркнутому и выделенному курсивом соответствующему пассажу, а также ссылкой на практику суда иной территориальной юрисдикции.

Подскажите, если я подам в суд на них, а суд признает что на третьем году пандемии корона все еще уважительная причина - я должен буду оплатить Streitwert?

Streitwert - нет, судебные издержки - да. И то только в том случае, если согласитесь с таким решением VG и не оспорите его успешно в VGH.