На что обращать внимание

На тот факт, что у таких квартир есть т.н. стандартный минимум. Изменить его можно легко, оплатив хотелки на стадии строительства.

Электрика - добавить во всех комнатах кол-во розеток. Продумать сразу освещение и в планируемых местах сделать дополнительно места для подключения. Не забыть балкон или терассу. По квартире от телефонной розетки проложить по всем комнатам кабель КАТ7, не забыть отдельный выход такого кабеля в тех местах, где будут висеть телевизоры.

Сантехника. То же самое, унтерпутц-подключения потом будут невозможны. Рассмотреть варианты слива для душа. Если высокие, просите сразу поднять унитазы выше стандарта. Заменить стандартную сантехнику, если не устраивает.

С сантехникой сложнее всего, так как там цены на изменения очень высокие. Но потом уже многое переделать не получится. Вы захотите отдельно-стоящую ванную и такую же арматуру, а всё. Поезд уехал.

Стены. Несущие Вам никто не даст менять, строители придерживаются основного проекта. Но….

Допустим, у Вас стена на кухне под высокие шкафы сейчас по плану 2,90. Стандартный шкаф 60 см. Обидно не воспользоваться тем, что стену можно сделать чуть длиннее, учитывая путц, и установить туда сразу 5 шкафов, вместо 4 и пустого куска? Если есть возможность, измените внутренние стены под свои хотелки по всей квартире. Где-то, быть может, установить швеллер и сделать дверь, которой нет в плане. А Вам удобней.

какие могут быть "подводные камни"?

Из моего наблюдения. На ноебау всегда ибанистически огромные деньги на содержание фервальтунга. Такое впечатление, что туда по умалчанию конкурс - кто сможет украсть больше. По принципу: такого класса жильё может себе позволить не каждый, поэтому драть их по полной.