Мне этот сервер как-бы по наследству достался.

Это многое объясняет.

Сам я туда ничего не забивал, но каждый апдейт естественно оставлял свой мусор.

apt-get запустить с опцией --help не судьба? или даже без опций, все равно будет help. Простые слова вроде (auto)clean, (auto)remove и тп ничего не говорят? там и пояснения обычно есть к каждой из этих опций. Правда если у линуксоида плохо с хотя бы примитивным английским, тогда ой...

Безграмотным как то и винды хватает, где не нужно учиться удалять лишния ядра

А что касается новых кернелов/ядер, то перед тем как учиться их удалять, нужно было спросить себя: что это такое, нужно ли вообще выкачивать новое ядро, что это даст, куда сохранятся новые файлы и тд Для этого для каждого из доступных для скачивания ядер есть ченджлоги и багрепорты. Золотое правило: если увидел что-то нужное или критичное, то ставь, а не увидел или не понял, игнорируй. Т.к. в отличие от винды в линуксе -- да и в любой нормальной ОС -- пользователь имеет возможность отказаться от любых ненужных ему апдейтов, а нужные перенести на любое подходящее ему время.

Ну и напоследок разочарую: удаление ядра просто сводится к удалению файла с диска, никакой особой магии тут нет.

ПС. Давайте-ка лучше о Win11.