Если на момент выселения моей прабабушке было около 10-11 лет, то на нее не может быть справок о репрессиях.

на бабушку (несмотря что 10 лет или даже если родилась в местах репрессий) тоже распространяется факт репресии, и она МОЖЕТ получить "Справку О Реабилитации" по национальному признаку
Другое дело- что она не подходит под критерий - наличие возраста 16 лет - на момент 1941 года, по дате применения репрессий (условная дата от BVA)

Я собираю документы уже больше года, и специально не отправляю их без полного сертификата В1, который будет готов уже через несколько дней, без всех справок и т.д. А тут эта архивная справка, которая вероятно тоже не нужна, т.к. было раскулачивание, а не по национальному признаку,

Вы не расстраивайтесь, люди и 2 года собирают документы, ничего тут страшного нет.
Еще раз отследите путь, часто бывает что раскулачивание при пересылки (и даже при переселении/ расселении из лагеря в лагерь) меняли статью сразу на Нац.Признак, чтобы не заморачиваться, такое бывало часто, особенно когда на спецпосление переводили.