И какая для детей разница, конкретно?

Точно такая же, как для взрослых: уедут надолго из Германии - не смогут вернуться без национальной визы.

А после 18ти для возвращения нужны будут основания.

Для последующего получения немецкого гражданства нужно будет выйти из имеющегося. Это время и деньги.

Ну и, есть некоторые профессии ( места работы) куда берут только граждан ЕС ( тех , куда берут только немецких граждан, наверное, почти не осталось )

Конкретно для ситуации типа ТС:

Например, семье может потребоваться вернуться в РФ до того, как дети получат немецкое гражданство, отказавшись от предыдущего. После 6ти месяцев отсутствия дети теряют внж.

Или, например, с немецким родителем за три года может случиться что либо. И ребенок станет обычным иностранцем, без привязки к немецкому родителю.

Выход из российского гражданства детей с двумя родителями- российскими гражданами, не выходящими из гражданства, по опыту форумчан, нереален.

То есть, или маме, или папе нужно тоже из гражданства выходить. А у них в РФ у обоих матери и потому они выхода, наверняка, не планируют