Если у вас СМS Contao версии 3.5.х, то РНР версия минимум должна быть 5.5, а рекомендуемая версия 5.6.2, если опираться на их инфу с сайта.

Что касается новой версии 4.3.4 , то она работает походу только на версии РНР 7, недавно пытался запустить её на версии 5.6, и без результатно. На 7-м пыхе не проверял.

Так что, если у вас 3.5 версия контао, то можете спокойно переключать на 5.6, смена пхп версии не испортит содержание сайта, бэкап тут не нужен. В случае же не стыковки версий пхп, если скажем сайт на очень старой версии контао, и не поддерживает 5.6 версию пхп, то просто появятся ошибки, если их показ не запрещён, и можно будет просто назад переключиться на с5.5 версию пхп. В таком случае придётся обновлять движок сайта, а вот тут бэкап уже будет не лишним, на случай если обновление пройдёт неудачно.

Что касается письма, то там ясно указано - "Wir werden die PHP-Version 5.5 langfristig nicht mehr unterstützen.", они с 20-го уберут только 5.5 версию, иначе бы они написали и про 5.6. Вообще, было бы смешно удалить из поддержки 5.6, это ветка последняя перед 7-й, 6-й версии нет и не будет, и 5.6 ветка судя потому что на сайте, ещё будет поддерживаться в плане выпуска исправлений безопасности в течении ближайших пары лет. А за это время, все движки сайтов и так перейдут на поддержку 7-й версии, ну а те кто не желает обновлять движки, это уже будет их проблемой.