Та почти о любом сайте можно сказать "Благодоря шаблону в дизайне присутствуют надоевшие элементы.
Присутствует ощющение что конект притянут к шаблону."

Относительно шрифтов... Я бы тоже заменил их на графику. Чисто типографский текст на данном фоне возможно и придает, как ты сказал, дисгармонию. Хотя..., это тоже кому как. Не надо забывать того, что заказчик не является дизайнером и не может предъявлять столь высокие требования. Видимо ему и так понравилось.
"Ни есть хорошо" - это не аргумент. Опять же - кому как.
Боковое меню, переход, отличие стартовой страницы от других - тоже дело вкуса и задумки. Сделай переход не дерганным - приплюсуй 300 евро. Видимо автор сайта не додумался, возможно и так хорошо платили . То есть то нету (меню) - чисто техн. сторона вопроса, не валите всё в одну миску. Отличие стартовой страницы несет в себе чисто привлекательный характер, все остальные - информационный. Повидимому именно такова была задумка. Мысли об экологии сегодня модно.
Резюме:

Тоже самое можно сказать по поводу любого тобой созданного сайта.
Не набивай, Андрей, себе цену. (уж прости за прямоту и искренность)
"Я хирург и мне часто приходится......" (с) Лукашин из "С легким паром"