Всё зависит от того, о какой разнице идёт речь?
Если брать к примеру полноценное создание сайта с нуля, то для того чтобы собрать сайт на джумле, максимум придётся прочесть одну-две статьи для углублённого изучения, при этом потратив пару дней на изучение. Если взять Typo3, и взяться за полноценное создание сайта с нуля, то придётся прочесть кучу документации по самому движку, потратив на это от месяца и больше, и также изучить основы HTML и CSS. И это всё для создания одинаковых по структуре и содержанию сайтов.
Если брать во внимание простое редактирование содержимого готовых сайтов, то тут вопрос спорный, где легче и проще.
Если подходить к разнице на уровне популярности, то если судить по разным источникам, то джумла на первом месте, тайпо на 2-м.
Если брать во внимание такой фактор как защищенность и сравнение системы с коммерческими CMS, то тут тайпо приравнивают к корпоративным системам, и лучшим по защищённости.
Так что, что лучше, это зависит от потребностей и возможностей. Подробней можно о системах найти на википедии, и сравнить что пишут о них. Также ставить обе CMS на локальный сервер, и пробовать работать с ними, что бы понять, что же всё таки лучше, и для каких целей.