Так-с, по порядку.
100 (и 200 тоже) - это обычный рейсовый автобус, но проезжает мимо туристических мест.
Круговые автобусы. Посмотрите вот тут http://www.berlin-city-tour.de/
http://www.bbsberlin.de/stadtrundfahrten.html
http://www.berolina-berlin.com/citycircle_haltepunkte.html
Это основные перевозчики туристов по Берлину, я сама не ездила на таких, поэтому кого-то конкретно посоветовать не могу. Но мне кажется, это оптимальный вариант обзорной экскурсии по городу для двухдневного пребывания.
Насчет экскурсии по Рейхстагу - мы ходили просто так, поднимались на купол и смотрели сами, больше никуда нас не пустили, видимо, надо отдельно заказывать.
Сан-Суси - это один из парков Потсдама. Точнее, это комплекс - парк, дворцы и музеи. Правда, я не уверена, что сейчас там будет красиво, т.к. еще нет зелени и, быть может, еще не включены фонтаны. Но все музеи должны работать.
Погулять вечером - можно начать от Pariser Platz (где Бранденбургские ворота), пройти по Унтер ден Линден, которая переходит в Karl-Liebknecht-Str. - до Александер Платц. Прогулка получится долгая, но пути увидите посольства разных стран, Государственную Оперу, Исторический музей, Университет Гумбольдта, Берлинский Собор и много чего еще.
Также можно прогуляться по Friedrichstrasse, которая пересекает Унтер ден Линден (там как раз много магазинов и бутиков и кафе) и свернуть оттуда на Gendarmenmarkt.
Что касается теплохода, я тоже собираюсь прокатиться, выбрала для себя вот это http://www.berlin-starting-point.de/Berlin_Stadtfuhrungen/berlin_schiffsfahrten/berlin_schiffsfahrten.html
Берлинский собор и Телебашня находятся недалеко друг от друга, пешком дойдете. Собор - там орган, красивое внутреннее оформление, крипта внизу, в хорошую погоду можно подняться на смотровую площадку.
Фрагменты стены - мне сейчас вспоминается только кусочек на Потсдамер Платц, может быть, другие форумчане подскажут еще.
Магазины - Kaufhof и Karstadt у Вас в Дортмунде должны быть, так что - KaDeWe (помимо всего прочего там, говорят, классный гастрономический отдел)
Мне Гугл выдал, что Ваш отель находится на Osloer-Str. http://www.berlin-mitte-hotel.com/
Подробную информацию по всем достопримечательностям, с указанием ближайших остановок транспорта найдете тут http://www.visitberlin.de/deutsch/sightseeing/d_si_sehenswuerdigkeiten.php