Я нашел гнездо. Тот, кто его свил, строил экологически, жил в согласии с природой Птицы - это разумная цивилизация?

Нет.

Современный человек уже научился разрушать атомные и молекулярные связи, в какой то степени менять их.

Первые рассы же были менее материализованы т.е имели тела которые гораздо глубже имели ментальные и духовные связи, и умели изменять атомные структуры по своему усмотрению, т.е. как пример; растущее дерево вырастало в то что хотели иметь - дом, мебель (если она (он) вообще существовали и требовались им).

Чувства это в какой то степени и есть то - что осталось нам от тогдашних ментальных (атомных) связей, вы же не будете утверждать что не чувствуете тепло или холод (они не материальны, это кинетическая энергия хаотического движения частиц, составляющих вещество), но мы чувствуем их, равно как и например порой возникающие чувства симпатии или неприязни к какому либо человеку, хотя вы его только впервые видите. (что это мы не очень то понимаем, но тем не менее чувствуем) Почему к примеру лежащие в одной комнате камень, железо, стекло, дерево и пластмассовое изделие (имеющие одинаковую температуру) мы воспринимаем по разному, т.е. камень, стекло, железо как правило холодные, пластик и дерево тёплыми?

Опять же как пример: взяв в руку кусок твёрдого пластелина и подержав его некоторое время, он становится мягким, да он нагрелся от тепла руки, что есть тепло?- увеличения скорости движения либо колебаний молекул и атомов, составляющих его. Но мы гораздо материальней чем прачеловек, и наша энергия гораздо слабее, но можно предположить, что имея в сотни или тысячи раз более сильную внутреннюю энергию, тогдашние люди могли с такой же лёгкостью (как мы из пластелина) "лепить" из камня и железа всё что пожелают.

Нынешний человек увяз в гордыне и материи (материя плотное вещество и вырватся из него тяжело), и поэтому отрицает всё что не увязывается с его нынешним мировоззрением. Возьмём собаку, достаточно "умное" животное, хорошё дрессирируемое, можно научить многим "трюкам" и командам, можно научить открывать двери (она поймёт для чего ручка на двери), у нас собака сама укрывается (она понимает для чего одеяло), можно научить включать компьютер,но никогда вы не сможете ей объяснить для чего нужна это "коробка" и как ею дальше пользоватся, её разум не способен это понять. Так же и человек, многие вещи хотя он видет их, просто не доступны для его осознания.

Человек мыслящий исключительно "материальными штампами", никогда не сдвинется с мёртвой точки, они резко ограничивают его мировоззрение. То что называется духовностью, это не просто поклонение кому то или чему то, это способность ощущать, видеть и осознавать то что чаще нельзя потрогать руками.