ну откройте эту страницу и скроллируйте, попутно делая скриншоты. Это самый простой вариант, который уже работает в полуавтоматическом режиме.
Проблема то, где именно пересекаются картинки. Но тут должен быть один максимум, так что попроще.

Вам надо вашу реальную задачу описать, а не в общем отвлечённом виде. В общем виде задача решается полным перебором всех точек изображения. А оптимизации идут уже от задачи - скроллить картинку и склеивать потом, или собирать мозаику из кусочков - это разные задачи. И по сути, в первой надо оптимизировать процесс снятия скриншотов, а не склейки. Т.к. если скриншоты сняты оптимально, то ничего оптимизировать вообще не надо. А если случайным образом, т.е. каждый новый скриншот может содержать произвольное число пикселей вдоль скролла исходной картинки, то придётся придумывать разные анализы по цвету или статистике. Но если исходная картинка содержит не ограниченное число цветов, как скажем веб-страница без фотографий, а какое угодно, как скажем фотография, то точность обеспечит лишь полный перебор всех пикселей. Все остальные алгоритмы дадут погрешность и какой-то процент неправильных склеек. Но даже полный, но последовательный перебор пикселей не сработает, если исходная картинка имеет повторяющиеся паттерны (как частный случай - плошная однотонная заливка) по всей длине склейки.

Вобщем, все оптимизации идут после максимально полного описания задачи. А "на все случаи жизни" - только полный перебор с каким-то решением против повторяющихся паттернов.