ты определись, что тебе нужно.

На каждом шаге разное

Для начала мне нужно рабочее приложение.

Затем среда для его тестирования.

А делать что то практически бесполезное смысла не вижу. Даже если я напишу все на заглушках, то оно будет только тестировать простейшую логику приложения и позволит с гордостью сказать вот у нас есть правильные юнит тесты.

А прога в итоге и не работает всегда правильно.

Если бы у приложения была бы какая-то нетривиальная логика, то еще какой то смысл был бы. А так, просто последовательность шагов: сжать и переместить.

Но всё завязано именно на манипуляциях с файловой системой, которую трогать низзя.

На крупной фирме с сотней программистов

Сорри, с такими еще не сталкивался и думаю что уже и не получится. Чтобы целая сотня над чем то одним работала.

Но в твоем случае (я не программирую на шарпе) на яве это элементарно

Не вижу особой разницы в языках, но и элементарности тоже не вижу.