Выкинул обе либы из проекта и потер все референсы.

Сделал папку для лог4нет и подпапки для каждой версии.

при добавлении либы к проекту дллки получил фигню:

<Reference Include="log4net, Version=1.2.12.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=669e0ddf0bb1aa2a, processorArchitecture=MSIL">

<SpecificVersion>False</SpecificVersion>

<HintPath>..\log4net\v.1.2.13\log4net.dll</HintPath>

</Reference>

и

<Reference Include="log4net, Version=1.2.12.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=669e0ddf0bb1aa2a, processorArchitecture=MSIL">

<SpecificVersion>False</SpecificVersion>

<HintPath>..\log4net\v.2.0.8\log4net.dll</HintPath>

</Reference>

при этом в свойствах ссылки указывается правильная версия - 1.2.13.0 и 2.0.8.0

При добавлении ссылки на ту же либу, но для аппы получил

<Reference Include="log4net, Version=1.2.10.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=692fbea5521e1304, processorArchitecture=AMD64">

<SpecificVersion>False</SpecificVersion>

<HintPath>..\log4net\v.1.2.13\log4net.dll</HintPath>

</Reference>

В общем - Я слегка офигиваю...