одна база со множеством таблиц, если "темы схожие", или все-таки как-то выделить направления и создать более структурированный "набор баз данных"?

-----

База - одна на одну задачу.

Если задачи связанные - то это одна задача.

Но обычно задают другой вопрос - если сущности похожи, но нужно ли заводить отдельную таблицу?

Ответ нас него прост - либо таблицу на каждую сущность, либо общий список сущностей и одна таблица с дополнительным ключем...

До 10-ка сущностей Я бы делал отдельные таблицы, больше - делал бы две таблицы.

можно ли создавать средствами субд реляции между отдальными базами данных?

-----

Давно хочу, но пока таких не видел.

Но не путай это с сегментацией файлов данных.

полная каша в голове : (

------

Это еще только начало... через годик - начнет побаливать...

По большому счету - пока тебе нужна нормальная интегрированность данных - у тебя одна база.

Ее разделение на части повлечет за собой ручное писательство проверок и поддержки интегрированности.