1. я не думаю, что Ваша знакомая приняла гражданство одного из балтийских государств, поскольку, как правило, при принятии такого гражданства необходимо отказываться от предыдущего. скорее всего в ходе "расследования" в консульстве выяснилось, что она приобрела это гражданство ранее в силу закона и на самом деле речь шла только о заявлении на выдачу паспорта.
2. даже если это не так и она действительно приняла это гражданство, не исключено, что сам ребенок приобрел его в силу закона (как это происходит например в России).
3. даже если это не так, и для получения ребенком этого гражданства требовалось обязательное заявление о приеме его в гражданство, ребенок немецкого гражданства не утратил, поскольку отсутствуют предпосылки утраты немецкого гражданства матерью (уже потому, что у нее такого гражданства нет).
4. даже если бы это было не так, и немецкое гражданство у матери было бы и она его утратила бы вследствие пункта 3, ребенок его не утратил, поскольку у него есть отец, имеющий как немецкое гражданство так и право опеки...