Я читал Ваши сообщения, понимаю Вашу точку зрения и не утверждаю, что Вы обязательно в чем-то фатально не правы. Я всего лишь обсуждаю, как это может выглядеть в итоге со стороны, в том числе потому что Вы ничего не обжаловали и не отстаивали свои права вовремя: Вы въехали по ошибочно выданной визе, подали заявление на ВНЖ без всяких на то оснований, и еще и просрочили визу. Отсутствие официального отказа никак ситуацию не меняет, поскольку Вы сами должны быть в курсе своих прав и обязанностей и заботиться о том, что Вы пребываете в Германии на законных основаниях. Правильно написали, что необходимо было до истечения визы получить Fiktionsbescheinigung (FB), а все эти письма непонятно как продляли Ваш легальный статус.

все, что Вы написали, не соответствует действительности: визу выдали правильно и законно, обжаловать было нечего, заявление на ВНЖ было подано обоснованно, виза не была просрочена.

Fiktionsbescheinigung (FB) получать не обязательно, достаточно до истечения срока действия визы подать заявление на ВНЖ, что и было сделано.