в принципе не вижу препятствий к подаче UK, просто надо быть готовым к тому, что издержки будут возложены на истца.

...потому что суд может посчитать, что вот та фраза в Akteneinsicht о принятии положительного решения означала окончание административного процесса и была известна истцу на момент подачи UK?

заодно можно выяснить, как действует § 75 VwGO в случаях, когда административный акт вступает в действие путем выдачи Urkunde.

BVerwG тут как-то разъяснил следующее:

2. Die Einbürgerung erweist sich auch nicht infolge Nichtigkeit als unwirksam (§ 43 Abs. 3 LVwVfG). Sie ist nicht aus einem der in § 44 Abs. 2 LVwVfG aufgeführten Gründe nichtig; insbesondere greift die Nr. 2 nicht, denn dem Kläger wurde die gemäß § 16 Satz 1 RuStAG erforderliche Einbürgerungsurkunde übergeben.

Это следует понимать как то, что § 44 Abs. 2 Nr. 2 VwVfG в принципе относится к процессу Einbürgerung, то есть, всё же административный процесс натурализации заканчивается в момент выдачи EBU, а не просто принятия положительного решения о натурализации. Да и печально известный случай невыдачи EBU с отказом в натурализации (именно отказом, а не отзывом решения о натурализации) из-за отказа пожать руку сотруднице ЕВН за секунду до выдачи EBU тоже говорит в пользу того, что подача UK является допустимой вплоть до получения на руки EBU.

второй интересный вапрос, какие могут быть вообще причины длительной задержки с распечаткой EBU

Скорее всего то, что распечаткой EBU занимаются 1-2 человека на Teilzeit, а не непосредственно Sachbearbeiter'ы, принимающие решения по сути.