Насколько я знаю, в 2014 году знакомый принимал гражданство Швейцарии, будучи немецким гражданином. И он не пожелал отказаться от немецкого, заплатив 5000€. Остались 2 гражданства.

А что, так можно?

Можно, но к Вашей ситуации этот случай не имеет никакого отношения. Вот просто вообще и совсем.

Подумайте сами: Ваш знакомый принимал гражданство Швейцарии, имея немецкое и будучи взрослым. Уже одно это сильно отличается от Вашей ситуации. Кроме того, Швейцария - не Россия, для Швейцарии есть специальные условия.

Например, немецкое гражданство при приобретении швейцарского не утрачивается, см. §25 Abs.1 StAG:

(1) Ein Deutscher verliert seine Staatsangehörigkeit mit dem Erwerb einer ausländischen Staatsangehörigkeit, wenn dieser Erwerb auf seinen Antrag oder auf den Antrag des gesetzlichen Vertreters erfolgt, der Vertretene jedoch nur, wenn die Voraussetzungen vorliegen, unter denen nach § 19 die Entlassung beantragt werden könnte. Der Verlust nach Satz 1 tritt nicht ein, wenn ein Deutscher die Staatsangehörigkeit eines anderen Mitgliedstaates der Europäischen Union, der Schweiz oder eines Staates erwirbt, mit dem die Bundesrepublik Deutschland einen völkerrechtlichen Vertrag nach § 12 Abs. 3 abgeschlossen hat.

Стало быть, 5000 евро он платил точно не немцам, поскольку немецкую сторону принятие швейцарского гражданства не беспокоит. Разве что Швейцария требовала выхода из немецкого гражданства, а он таким образом откупился. Про возможность такого варианта ничего сказать не могу, не знаю швейцарский закон о гражданстве. Но в любом случае "денежные разборки", если они были на самом деле, были не с немецкой стороной, а со швейцарской.

При посещении Einbürgerungsbehörde я спросила про ребёнка, что будет, если он не откажется по достижению 18 лет от российского гражданства. Мне сказали, будет платить штраф.

Это странно. На каком основании ребенок приобрел немецкое гражданствно?