На данный момент работаю в компании уже почти 6 месяцев.

Ну вот могли уже почти 6 месяцев, как подавать на ПМЖ. Если только муж посодействует в получении, то есть не будет против расписаться в Ausländeramt-e, что брак продолжается.

Поэтому пока не бузите и не трещите по швам. Или работайте тогда ещё 5,5 лет и получайте свой собственный ПМЖ, без мужа. Да, срок далековат. Так что не ссорьтесь с мужем пока окончательно.

Могу ли я проживать до окончания срока bAE или попросят уехать сразу после развода?

Что Вы все трепетно-пугливые такие? Ну прям в самолёт запихивают и отправляют домой. Откуда такая страшилка в голове.

С 2018 года Вы могли бы проживать от мужа отдельно и никто ни полслова не сказал бы, если бы Вы хоть кое-как работали.

В случае развода нужно ли менять bAE, который был выдан для воссоединения семьи и например получать рабочую визу?

Не надо Вам уже никаких рабочих виз. Живите спокойно. Будете жить по другому параграфу и всех делов.