Директивы должны имплементироваться в национальном законодательстве, которое и применяется.

Это почти так. Однако при наличии коллизий именно директивы играют определяющую роль. Суд ЕС руководствуется именно директивами, а не нормами национального законодательства стран участниц. Тем более данный случай - это не сугубо внутригерманское дело, его можно рассматривать в трансграничном контексте. Германия не является самостоятельным государством, она связана нормами права ЕС. Вопрос лишь в том, какие нормы следует считать превалирующими. А это уже на усмотрение суда.

Согласно процитированной статье именно немецкий законодатель должен проработать случаи, в которых АК выдается менее, чем на пять лет, а никаких исключений указано не было.

Это дискуссионный вопрос. И я не вижу однозначного ответа. Это вопрос правоприменительной практики.

В любом случае, ограничение АК сроком каких-то контрактов выглядит очень произвольным. Гражданин ЕС может остаться и для поиска работы после окончания контракта.

Это мнение охотно разделяю. Но рассудить и подвести черту может только суд.

Поэтому это дело законодателя - устанавливать ограничения, а не АБХ.

Совершенно верно. Но немецкий законодатель крайне небрежен и создает неконкретные законы, где нет четких критериев достаточности и необходимости. Директива ЕС содержит отдельную статью, которая оговаривает срок действия. А немецкий законодатель эту диспозицию упускает, а ограничивается лишь дополнением к предложению о порядке выдачи АК. Следует ли считать это предложение исчерпывающим и таким, которое не подлежит расширеному толкованию в контексте диспозиций Директивы? Это вопрос на усмотрение суда. Немецкий законодатель очень много отдает на откуп чиновнику АБХ. Например, определение достаточности финансов для незанятого гражданина ЕС. Нигде в законе нет четких критериев, и лишь Административный регламент поясняет, что следует принимать за критерий достаточности.

Аналогично, тот же Административный регламент от МВД Германии содержит диспозицию и про меньший срок действия АК, которая согласуется с Директивой. Однако немецкий закон об этом ничего не говорит.

Вывод : если АБХ стоит на своем - только суд может принудить АБХ изменить решение!