Приехать учиться в Германию на год без визы - Richtlinie (EU) 2016/801
Разница в том, что раньше там было написано "kann [...] erteilt werden", сейчас там написано "wird [...] erteilt" -- https://www.buzer.de/gesetz/4752/al0-63692.htm
Если у вас есть Zulassungsbescheid от университета и все остальные необходимые документы, вы просто прописываетесь и идете в АБХ ставить заявление на выдачу студенческого ВНЖ. Ваш латвийский ВНЖ используется только для возможности въезда в Германию (потом он утратит силу, ну или выясняйте, что там с ним будет), поэтому университет так и написал.
Только не тяните долго, потому что не ясно, сколько времени это может занять. Только карточку ВНЖ делают 6 недель, а еще нужно время на возможное ожидание термина, да и АБХ будет наверняка какое-то время рассматривать заявление. В общем, на мой взгляд, у вас уже времени впритык.
UPD.
А, подождите.
(2) Des Weiteren setzt die Erteilung einer Aufenthaltserlaubnis, einer ICT-Karte, einer Niederlassungserlaubnis oder einer Erlaubnis zum Daueraufenthalt – EU voraus, dass der Ausländer
1. mit dem erforderlichen Visum eingereist ist und
2. die für die Erteilung maßgeblichen Angaben bereits im Visumantrag gemacht hat.
Hiervon kann abgesehen werden, wenn die Voraussetzungen eines Anspruchs auf Erteilung erfüllt sind oder es auf Grund besonderer Umstände des Einzelfalls nicht zumutbar ist, das Visumverfahren nachzuholen. Satz 2 gilt nicht für die Erteilung einer ICT-Karte.
Это формулировка § 5 AufenthG, который требует получения въездной визы. И тут внезапно стоит "kann abgesehen werden, wenn die Voraussetzungen eines Anspruchs auf Erteilung erfüllt sind". Anspruch при наличии всех документов у вас выполнен, но kann говорит о том, что визу могут и затребовать. В общем, судя по всему, как повезет.
Хотя вот интересно. Если заявитель приехал без визы и получил на месте ГК, то его получается тоже могут отправить за получением въезной визы, когда он придет за NE или DA-EU?