В общем, не сдаются ребята. Собираются отказать, вот: https://www.dropbox.com/s/eo37r3qllln49s2/images.pdf?dl=0

Нда, печально. Мюнхенское АВН, видимо, действительно настолько велико, что актуальная информация не доходит до всех его сотрудников...

Так что больше похоже на собственное трактование закона.

Абсолютно верно. Поэтому я бы на Вашем месте сделал следующее:

1. Потребовал бы от АВН письменное объяснение, на каком законном основании "bei der Erteilung einer Niederlassungserlaubnis entfällt automatisch die befristete Blaue Karte EU". Поскольку §51 AufenthG такого варианта не предусматривает, будет очень интересно почитать объяснение АВН, т.к. тот текст, который они прислали Вам сейчас, выглядит действительно слишком фривольной трактовкой действующего законодательства по принципу "чтобы АВН было проще".

2. Сослаться в этом письме на случай usermuc, который недавно - спустя год переписки и дискуссий с мюнхенским АВН - всё же получил желаемую комбинацию ВНЖ. При этом следует указать, что отказ в выдаче двух ВНЖ в Вашем случае будет уже дискриминацией.

3. Параллельно написать Fachaufsichtsbeschwerde в упомянутый Regierung von Oberbayern и попросить их помочь решить вопрос в досудебном порядке. Копию этого письма (можно его отправить даже по email; тогда можно сразу в СС) обязательно(!) отправить в ближайшие две недели мюнхенскому АВН, чтобы те были в курсе, что с ними свяжется Regierung, и не торопились в течение двух недель принимать поспешных решений.

4. Если это не поможет, идти в суд. Это, конечно, потребует немного времени и (сперва) денег, но шансы очень неплохие. Впрочем, я думаю, что всё должно решиться положительно ещё с помощью первых трёх пунктов.

Момент с тем, что Ваш случай не сравним с решением BVerwG по причине того, что там истцом был турок, вообще очень смешной, поэтому тут без комментариев