Вы поймите, "пропиской" занимается одно ведомство, разрешением на пребывание совсем другое. Прописка по шенгенской визе не запрещена, но и не нужна. Более того, она может создать Вам проблемы в АБХ, особенно при пребывании по визе, выданной в польском консульстве. А в АБХ теоретически могут - при самом неблагоприятном раскладе - и действительно из страны выгнать, если Вы и им будете так же невнятно объяснять, как здесь на форуме, зачем вдруг понадобилась прописка по шенгенской визе и почему приехали на 3 месяца в немецкую школу. Вам бы наоборот находиться на территории страны тихонько, а Вы хотите "светить" своё пребывание.

Вся идея с немецкой школой по шенгенской визе бредовая. Если Вы немец, то оформляйтесь как ПП, получайте гражданство, а после этого можете находиться в Германии сколькуо угодно, ребенок сможет учиться в школе и пр. В конце концов, если у семьи будут немецкие паспорта, жить именно в Германии никто никого заставлять не будет.