О, какие знакомые милые штучки. Прямо Арзамас-16 какой-то ... Секретный ученый, секретная диссертация, "перед прочтением сжечь" ...

К слову, о стаже человека судят по словам самого человека: "так как опыт практически нулевой (2-3 года)". И о публикациях, тоже к слову: "большинство из них еще при студенчестве были сделанны и не совсем в той сфере по которой сейчас работаю".

Разумеется. Если обратите внимание, я сказал, что вряд ли профессор напишет правильное письмо. Разницу, надеюсь, понимаете. И про расшифровку цойгнисов слышали, наверное.
Вы бы внимательнее читали, прежде чем ...

Отдел по борьбе с иностранцами держится на 1) инструкциях 2) усмотрении чиновника.
Положительными факторами, характеризующими Hoch-Qualifizierte могут быть
- диссертация, лучше Habilitation (нет вообще)
- стаж работы по данной специальности (нулевой, 2-3 года)
- постоянный контракт (нет)
- зарплата (без диссера, без стажа - подозреваю, что небольшая)
- список публикаций (мало и не по теме)
- письмо профессора (а что он может реально хорошего написать, если человек только недавно Уни закончил и всего пару лет проработал)
- руководство группой (нет)
- работа со студентами и аспирантами (нет)
- ключевое участие в крупных международных проектах (нет)
Спуститесь на землю. Сотрудники АБХ люди зачастую малоприятные. Но они не идиоты. И с таким набором факторов (в их красноречивой совокупности) отфутболят не задумываясь.