не волнуйтесь, с практикой все должно быть ОК.
Лимит в 90 дней в год существует только для занятости, которая вообще не является частью учебного процесса (навроде мини-джоб подработки за 400).
А если вы делали pflicht- oder freiwilliges Praktikum, то это предписано университетом и проблем не вызывает. Опять же, *рекомендация* в 6 недель только рекомендацией и является, а не жестким предписанием.
Я в свое время примерно так же сделал:
- 6 месяцев pflichtpraktikum,
потом 6 месяцев freiwilliges Praktikum (на той же фирме),
потом 6 месяцев диплом,
потом нашел в той же фирме работу.
Никаких вопросов по поводу этого у Ausländerbehörde не возникало, каждый раз по предъявлению контракта на практику шлепали очередную учебную визу на полгода-год.
Единственный нюанс - для freiwilliges Praktikum уже не надо было явного разрешения от универа (только наличие студенческого и устное согласие), и я платил несколько сотен евро налогов каждый месяц (видимо, проходил по категории "Werkstudent").
Разрешение на работу в Вашем случае тоже должны выдать шустро (и, конечно же, без выезда из страны!) - т.к. фирма Вас уже знает и вполне может посодействовать.