Вообще, оффтоп эта тема тут.

Пока не закрыли, отвечу по сути (настолько точно, насколько сам в курсе)

1) Не самые лучшие оценки - это, конечно, минус в академической среде. Если слишком плохие, то может вообще закрыть двери все. Одно ясно, что без личного впечатления хорошего и без рекомендаций это не исправить. Конечно, работодатель предпочтет человека с хорошими оценками просто после прочтения резюме. Учтите, что кроме Вас пытаются рассылать свои резюме массово выпускники из Индии, например, и не факт, что Вы в выигрышной позиции.

2) Обычно, особенно когда речь идет об институтах, все-таки аспиранта берут на 1/2-3/4 ставки. То есть это либо стипендии, либо вакансии. Искать надо прежде всего их, а не просто рассылать свое резюме. DAAD и другие программы - тоже хорошее дело.

3) Поступить в аспирантуру в каких-то университетах без зарплаты тоже можно, но тогда Вам надо как-то себя содержать, ВНЖ получать, и без поддержки это будет сложно. Если есть какие-то сбережения (8 тыс евро на год на заблокированный счет), можно попробовать, но надо тогда личные контакты с конкретными профессорами устанавливать, и это конечно без личного присутствия в Германии не удастся. Можно попробовать не работу искать, а просто предлагать приехать сделать доклад по той тематике, что занимаетесь (возможно, что и за Ваш счет). Если кто-то заинтересуется, может, тогда и найдете руководителя.