Бакалавр из уни действительно может быть предпочтительнее для дальнейшего обучения на магистратуре в уни. Например, бывает просто Master, а бывает Consecutive Master. При поступлении на последний, уни тщательно проверяет соответствие программы бакалавриата, пройденной кандидатом, той программе бакалавриата, которая преподается в этом конкретном вузе. В случае с FH или "коротким" бакалавриатом, можно либо вообще не поступить, либо поступить с доп. условиями и учить на 8-30 кредитов больше, там уже как приемная комиссия решит. Это стандартная практика для Computer Science / Informatik, у нас на потоке половина студентов не знают, как бы сдать эти "допы": они обычно жутко теоретические (как раз чего в FH не особо принято преподавать), лекции по ним если и идут, то только на немецком, и там комплексный экзамен до кучи... короче, мало приятного.
В остальном, FH имеет массу плюсов: это и бóльшая практическая направленность, и бóльшая "доступность" преподавателей для студентов - всегда можно назначить термин и пройтись по учебной программе, тогда как в большинстве вузов некоторых профессоров вообще не выловить.Выбор в любом случае за ТС, но я бы обратил внимание не только на престижность вуза, но и на учебную программу и отзывы других студентов. CHE Hochschulranking auf ZEIT ONLINE составляется на базе отзывов студентов, плюс можно и лично отыскать благодаря соцсетям, у них можно не только спросить мнение, но и раздобыть слайды и протоколы экзаменов, чтобы просто прикинуть, что предстоит. Есть вузы, которые натурально высасывают из студента всю душу, занижая балл за каждый чих, и в итоге престижность вуза перебьется средней оценкой на уровне 3.5 и капитально расшатанными нервами... Ни то, ни другое не восстанавливается ;-)

Bla-bla...

может уже хватит изливать здесь свой поток сознания??..