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Medizinisch-technische Assistenten für Funktionsdiagnostik untersuchen, analysieren und bewerten, nach ärztlicher Anweisung, weitgehend selbstständig die Funktion von menschlichen Organen wie Lunge, Herz und Gehirn. Auch im Hals-Nasen-Ohren-Bereich führen Medizinisch-technische Assistenten für Funktionsdiagnostik Untersuchungen durch. Des Weiteren kontrollieren sie das Seh- oder Riechvermögen sowie die Funktionalität der Blutgefäße, der Muskulatur und des Gleichgewichtssinns. Zum weiteren Aufgabengebiet gehört auch die Kontrolle der Funktionsfähigkeit von medizinischen Produkten, beispielsweise Hörprothesen oder medizinischen Schrittmachern für bestimmte Organe, und stellen sie gegebenenfalls auf veränderte notwendige Werte ein.
Ihre Arbeit erledigen sie mit Hilfe komplexer medizinischer Apparaturen und Messgeräte (zum Beispiel mit Elektrokardiographen, Computertomographen oder Audiometern), unter Verwendung ihrer medizinischen und technischen Kenntnisse. Diese medizinischen Geräte müssen aber nicht nur bedient, sondern auch gepflegt und gereinigt werden; kleinere technische Störungen können sie unter Umständen sogar selbst beheben.