Ну вот Вы сами и ответили на свой же вопрос.
Вы утверждаете, что судебной функции у ООН нет и поэтому он не мог передать её уцгреждённому ею трибуналу.
Вы привели в доказательство цитату, из которой видно, что ООН имеет правов рамках "выполнения своих функций": требовать, расследовать, рекомендовать, делать сторонам рекомендации, решать, предпринимать действия, приглашать, составлять планы.
Вы видомо упустили слово "расследовать". Дело в том, что одной из функций суда является именно расследования материалов дела. Вот лишь несколько заголовков из инета:
Французский суд расследует утечку секретных материалов в газету Le Monde
РИА Новости - В мире - Мадридский суд расследует злоупотребления бывшего ...
Суд расследует финансовые махинации Пиночета :: Хартыя'97 :: Навiны :: 21/07 ...
Суд расследует попадание сальмонеллеза в шоколад Cadbury | Газета.Ru: Деловые ...
Ясно, что имея функцию расследования ООН имел право передать её специально созданному органу.
Но даже если бы это не было записано в Уставе ООН, есть в мире прецеденты создания судебных органов организациями, самими не имеющих судебных полномочий. Например, Конституционный суд РФ был создан сьездом народных депутатов, судебными полномочиями не распологающего.
Ну и наконец.
Если бы легитимность МТ была спорной, то страны, члены ООН ( а не толъко Вы, Милошевич, юрист Александрова и ещё пара-тройка адвокатов местного значения) поставили бы вопрос о его легитимности. Было ли это сделано?
По-моему по вопросу о легитимности МТ всё ясно. Мотивация Милошевича ясна и понятна также.