В том, что Вы написали можно обозначить несколько вопросов:
1. Может ли верующий служить в армии и применять летальное оружие для защиты своих детей, родителей, сестёр..., страны, где живёт его семья?

Вера возникла не сейчас и всегда верующие служили в армии и применяли летальное оружие, и при царе тоже за царя-батюшку в бой шли. А где же быть священнику, как не рядом с верующими, так всегда было. И какая разница, что государство у нас светское, если в государстве есть верующие люди, ведь государство состоит из людей.

2. Может ли государство платить зарплату священникам, которые будут справлять свои обязанности по отношению к верующим военнослужащим?

А почему государство не должно обеспечивать священнослужителей, ведь они помогают верующим военнослужащим, которые несут государственную службу. При частях есть и психологи по работе с военнослужащими. А верующим нужен "свой психолог". Во всех странах есть верующие и есть священники, которые тоже хотят есть и их дети тоже голодать не должны. Во всех странах организовано обеспечение священников. В Германии, например, взимается налог на содержание церкви и священнослужителей, государство тоже не остаётся безучастным по отношению к церкви, если верующим гражданам церковь необходима и специальные классы в школах для верующих детей организованы.