Ключевое слово "не совсем правильно организованный". Референдум в Крыму нельзя признать по важным причинам:
1. Подсчет голосов проводили люди, которые в случае ответа "нет" вынуждены были бы сложить руки за спиной и отправляться в украинскую тюрьму надолго. Уже поэтому нельзя верить результатам.
2. Не было кампании - власти Украины не могли агитировать, приводить аргументы и пр. Пути в Крым были перекрыты незаконными военными формированиями.
3. Референдум был проведен при присутствии значительного контингента российской армии - референдумы не проводятся на оккупированных территориях, их результаты не могут быть признаны.
4. Референдум можно проводить только в рамках конституции той страны, в которой Крым состоит по закону и нормам права.
5. Референдум был не нужен, так как в 1992 году жители Крыма со значительным перевесом решили оставаться не территории Украины.
И главный аргумент - можно говорить о независимости Крыма, но о присоединении к России - нельзя. Первое - вполне вписывается в международные нормы, второе - нет. Россия не имела права силой отбирать полуостров у Украины, так как подписала ряд документов о целостности Украины в ее границах с Крымом. Таким образом, референдум просто фактически беспредметен - и потому незаконен.