Конкретно МИД - подчинён Президенту РФ Медведеву
ВЫ бы прежде чем показывать свою абсолютную некомпетентность в данном вопросе
-прочли бы соответствующие документы . Вот вам домашенее задание : см.пункт 3
(с)Структура федеральных органов исполнительной власти
Федеральные министерства, федеральные службы и федеральные агентства, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ, федеральные службы и федеральные агентства, подведомственные этим федеральным министерствам:
1. Министерство внутренних дел Российской Федерации.

Федеральная миграционная служба.
2. Министерство РФ по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.

3. Министерство иностранных дел РФ.

Федеральное агентство по делам Содружества Независимых Государств.
4. Министерство обороны РФ.

Федеральная служба по военно-техническому сотрудничеству.
Федеральная служба по оборонному заказу.
Федеральная служба по техническому и экспортному контролю.
Федеральное агентство специального строительства.
5. Министерство юстиции РФ.
Федеральная служба исполнения наказаний.
Федеральная служба судебных приставов.
6. Государственная фельдъегерская служба РФ (федеральная служба).
7. Служба внешней разведки РФ (федеральная служба).
8. Федеральная служба безопасности РФ (федеральная служба).
9. Федеральная служба РФ по контролю за оборотом наркотиков (федеральная служба).
10. Федеральная служба охраны РФ (федеральная служба).
11. Главное управление специальных программ Президента РФ (федеральное агентство).
12. Управление делами Президента РФ (федеральное агентство).
http://www.aif.ru/society/article/18775