Фенотип (внешние признаки) и в самом деле запрограммирован в генотипе, но и то такой важнейший параметр, как пол, не запрограммирован автоматически! На определённом этапе развития эмбриона включается программа производства тестостерона, и развитие эмбриона направляется в сторону рождения мальчика. Но если произойдёт сбой включения (а это может быть вызвано внешними факторами) или возникнут (опять-таки в связи с внешними факторами!) перебои в производстве тестостерона, то может родиться гермафродит или будущий трансвестит...

В каком смысле "самым умным"? С точки зрения животных - наоборот, самым бестолковым, так как у человеческого детёныша отсутствуют врождённые инстинкты, свойственные детёнышам животных...Да и слабенький он, человеческий детёныш, беспомощный по сравнению со своими ровесниками-зверятами...Ведь по-хорошему, чтобы человеческий детёныш рождался на свет столь же подготовленным к жизни, как "братья наши мЕньшие", женщина должна была бы носить ребёнка чуть ли не два года...Но, так как в таком случае прямоходящая самка не смогла бы выносить плод, да и разродиться не смогла бы, так как ребёнок оказался бы слишком большим для прохождения по родовым путям, то рождаемся мы с вами, по большому счёту, сильно недоношенными, фактически не готовыми к самостоятельному существованию...Вид гомо сапиенс, кстати, не единственный пример рождения недоношенных детёнышей. Вон кенгуру своих тоже в сумке донашивают...