Вы попали в самую точку!
Уже удалось расшифровать геном неандертальцев, но вот выводы об "Urvolk" современных людей почему-то делают не на основе фоссильных гаплогрупп, а на основе сегодня живущих людей, и притом только мужчин, и это полный абсурд.
3а 3 000 лет столько перемешалось, что делать вывод о народах, которые проживали 3000 лет назад на основе религиозной принадлежности и национальной самоидентификации сегодня живущих людей могут только религиозные фанатики и сказочники.
Чего проще проанализировать гены египетских мумий, хазарских захоронений, и гены какой-нибудь Moorleiche, и на основании этого делать выводы, что гены сегодня живущих людей сходны либо с генами египетских мумий, либо с генами ископаемых хазар, либо с генами германцев, найденных в болотах Польши.
Вполне допускаю, что у ископаемых мужчин-кельтов могут найти монгольские гаплогруппы, у ископаемых монголов - арийские гаплогруппы, а у ископаемых арийцев - африканские.

Вообще мужские гены играют очень незначительную роль в корреляции между определенным этносом и геномом.
Язык и культура передается по материнской линии, не даром в германских языках "родной язык" переводится как "язык матери". Поэтому и следует больше внимания уделять митохондральным ДНК.
Но Хаммер и Ко отлично понимали, что если иудеи имеют какую-то гомогенность, то ее следует искать у мужчин-коганов, вот и повелось в генетике искать корреляцию между генами и культурами, языками или религиями на основе мужских гаплогрупп.