У меня лично априори отрицательное отношение к любым националистам, будь они русские, украинские или немецкие. Национализм - это всегда тупость и деструкция. Но, как правильно указал Алекс, нужно воспринимать слова Путина в контексте всего обращения к Меркель. Из контекста прекрасно видна ироничность высказывания российского президента, вполне понятно, что он хотел этим сказать.
Если взглянуть на проблему более широко, то на Ваш вопрос может быть однозначный ответ: нет, Путин не является русским националистом, равно как советским националистом или империалистом. Политика нынешней кремлевской администрации не является русским национализмом ни по прокламатике, ни по действиям, Кремль не проводит внутреннюю и внешнюю политику исключительно в интересах одного-единственного этноса, русского, из населяющих РФ. Равно не является она и "империалистической", т.к. РФ ведет себя на мировой арене скорее излишне скованно.