Есть печать о приобретении гр-ва РФ на переводе немецкого св-ва о рождении, печать консульства во Франкфурте.

Значит у вас есть действительный документ, подтверждающий наличие у вашего ребенка гражданства РФ. Уже легче. Осталось только оформить ему российский загранпаспорт. Вы бы сильно облегчили себе эту задачу, если бы озаботились ее решением своевременно, а не после того как.

Когда я выходила из гр-ва РФ, мне так и сказали, что ребенка вписывать в заявление не надо.

Вообще-то это вам решать надо или не надо, независимо от того, так сказали или не так сказали. Но можно и так, по подсказке, как сказали так и делать. В любом случае, решение ваше было добровольным. Никто вас к нему не принуждал.

Придется, скорей всего, ехать в консульство и уже на месте узнавать, что же нам все-таки делать.

Конечно съездийте, узнайте. Кто-нить, че-нить да подскажет, посоветует. Вам ведь это необходимо. По-другому отважиться на какое-либо неприведигоспадисамостоятельное решение вы ведь не в состоянии?