В таком случае доказать невозможность долгосрочного пребывания в Украине с целью оформления паспорта и/или выезда на ПМЖ уже вряд ли будет возможно. Разве что сын поступит в университет и там необходимо будет посещать лекции.

Имеется в виду беженцы в понятии Конвенции о статусе беженцев 1951 года.

Например, об этой.

Верно.

Ребёнок имеет не право на гражданство, а гражданство. Разница очень большая.

Какие законы о гражданстве будут в Украине и Германии через шесть лет, Вам сейчас никто не скажет. Но если руководствоваться сегодняшним законодательством, то Ваша дочь сможет восстановить гражданство Украины самостоятельно (к тому времени она уже будет совершеннолетней и родители уже ничего не решают). Если при этом она предварительно не получит разрешение Германии на сохранение гражданства Германии, она его автоматически утеряет.

Потому что согласно украинскому законодательству, законными представителями несовершеннолетних людей являются их родители, в т.ч. и в вопросах выхода из гражданства.

В том, что выход из гражданства является одним из требованием немецкого законодателя для натурализации иностранца в Германии. Вы же именно этого хотите для своей дочери как её законный представитель?
Да, кстати, по каким паспортным документам Ваши дети пребывают сейчас в Германии?