УФМС не занимается ни уголовным преследованием граждан, ни установлением места жительства граждан. Нет у них ни полномочий таких, ни технической возможности разбираться в Ваших иностранных документах. Поэтому все внутренние приказы и распоряжения ФМС относятся исключительно к работе с гражданами, которые пришли добровольно уведомить, т.е. которые своим письменным заявлением признают, что они живут в РФ. Т.к. неоднократно были случаи, что у людей отказывались брать уведомление на основании их устного заявления, что они живут на ПМЖ заграницей. И подобные разъяснения позволяют избежать таких случаев: это логично, это понятно - рядовые клерки по сути не имеют полномочий отказывать людям в праве уведомления.
Что касается полей в анкете, это просто не аргумент - во-первых, человек вообще не обязан иметь регистрацию в РФ, во-вторых, человек может жить в РФ, но не на одном месте, или вообще базироваться зарубежом, но пребывать в постоянных командировках в РФ. Случаев полно, и форма уведомления должна их все учитывать.
Выявлением граждан, живущих на ПМЖ в РФ, и не уведомивших о наличии ВНЖ/гражданства, занимаются ФСБ и СК (сбором доказательств и преследованием). Никто из них свое мнение в надежных источниках, по крайней мере, не высказал. Единственный комментарий был в gazeta.ru, что они отталкиваются от тех же критериев, что и при установлении налогового резиденства, плюс необходимы дополнительные факторы для уголовного преследования (какие непонятно).
Так что до сих пор нет никаких доказательств правоты Вашей версии. Надо продолжать следить за развитием событий, и желательно пока по возможности в РФ не ездить.